กลุ่มศึกษาข้อตกลงเขตการค้าเสรีภาคประชาชน หรือ เอฟทีเอ ว็อทช์ แสดงความกังวล ร่างกรอบเจรจา เอฟทีเอไทยกับสหภาพยุโรป หลังพบว่า เนื้อหาที่เกี่ยวข้องกับประโยชน์ของประชาชนในภาพรวม จะเขียนเเบบกว้างๆ ส่วนภาคธุรกิจกลับเขียนอย่างรัดกุม
โดยเฉพาะประเด็นทรัพย์สินทางปัญญาข้อ 5.11.1 ร่างกรอบเจรจาระบุว่า ระดับการคุ้มครองทรัพย์สินทางปัญญา เช่นเดียวกับ ระดับการคุ้มครองตามความตกลงขององค์กรการค้าโลก หรือความตกลงใดๆที่ไทยเป็นภาคี
เเต่เอกสารที่สำนักงานอ.ย. เสนอต่อคณะกรรมาธิการของรัฐสภากลับระบุว่า ผลกระทบสำคัญที่ไม่อาจมองข้าม คือการผูกขาดข้อมูลทางยา ซึ่งสวนทางกันอย่างชัดเจน ที่ประชุมจึงเห็นว่าหากไทยจะเจรจาการค้าเสรีกับยุโรป ผูกมัดด้วยบทบัญญัติการขยายอายุการคุ้มครองสิทธิบัตร เเละการผูกขาดขึ้นทะเบียนยา จะทำให้ยามีราคาเเพงจึงเสนอให้กรมเจรจาการค้าระหว่างประเทศนำร่างฯนี้ ไปพิจารณาเเก้ไขก่อนที่จะส่งเข้าสภา