พื้นที่ทำรังวางไข่นกใหญ่ที่สุดในประเทศถูกคุกคามพื้นที่ชุ่มน้ำในเขตห้ามล่าสัตว์ทะเลน้อย ถือว่าเป็นแหล่งทำรังวางไข่ของนกที่ใหญ่ที่สุด ในประเทศไทย แต่ขณะนี้กำลังถูกคุกคามอย่างหนัก โดยเฉพาะกลุ่มทุนซึ่งบุกรุก เพื่อนำพื้นที่มาใช้ประโยชน์ทางการเกษตร จนส่งผลกระทบต่อที่อยู่อาศัย ของนกหลากหลายชนิด
อธิบดีกรมอุทยานฯ เชื่อ กลุ่มก่อความไม่สงบ จชต. เชื่อมโยงขบวนการตัดไม้ป่าบูโดอธิบดีกรมอุทยานฯ คาดกลุ่มลักลอบตัดไม้ในอุทยานแห่งชาติบูโดฯ จ.นราธิวาส ขายนำเงินสนับสนุนกลุ่มก่อความไม่สงบในจังหวัดชายแดนใต้ บูรณาการร่วมแม่ทัพภาค 4 ฝ่ายความมั่นคง ฝ่ายปกครอง หาทางแก้ไขด่วน ระบุถูกตัดทั้งหมด 7 ต้น ไม่กระทบแหล่งเพาะพันธุ์นกเงือก