วัตถุพยานที่ถูกพบทั้งในและนอกโกดัง จ.พระนครศรีอยุธยา หลังเกิดเพลิงไหม้ ทำให้หลายฝ่ายตั้งข้อสังเกตว่า ผู้ก่อเหตุอาจจะมีเป้าหมายทำลายสารเคมีและกากอุตสาหกรรมที่เก็บไว้ในโกดัง ทั้ง 5 หลัง ประเด็นนี้ ทำให้เกิดคำถามว่า หากสิ่งที่ถูกเก็บไว้เสียหายทั้งหมด จะส่งผลต่อคดี รวมถึงกระบวนการกำจัดและฟื้นฟู ที่ดำเนินการอยู่ก่อนหน้านี้หรือไม่
หลังเหตุไฟไหม้โกดังเก็บสารเคมีใน อ.ภาชี จ.พระนครศรีอยุธยา ฝ่ายพิสูจน์หลักฐานพบวัตถุพยานจำนวนมากที่บ่งชี้ว่า "จงใจวางเพลิง" โดยในวันนี้ (6 มี.ค. 67) ทุกหน่วยงานในจังหวัด และจากส่วนกลาง ร่วมกำหนดแผนดำเนินคดี และการกำจัดสารเคมี หรือกากอุตสาหกรรม ที่ยังมีอันตรายตกค้าง