นักวิชาการตั้งข้อสังเกต หลัง
รองศาสตราจารย์สมพร อิศวิลานนท์ นักวิชาการอาวุโสสถาบันคลังสมองของชาติ ระบุว่า การชี้แจงของกระทรวงพาณิชย์ในการดำเนินโครงการรับจำนำข้าวในช่วง 1-2 ปีที่ผ่านมา ไม่สามารถตอบคำถามที่หลายฝ่ายสงสัยได้ โดยเฉพาะประเด็นผลขาดทุนทางบัญชี ซึ่งกระทรวงพาณิชย์อ้างว่า จนถึงขณะนี้ยังไม่มีการปิดบัญชีโครงการรับจำนำข้าวเพราะยังมีข้าวเหลือในสต็อก เป็นสิ่งที่ไม่สามารถรับฟังได้ เนื่องจากสามารถประเมินผลทางบัญชีได้ และการระบายข้าวไปและได้คืนเงินให้กับธนาคารเพื่อการเกษตรและสหกรณ์การเกษตร หรือ ธ.ก.ส. ไปแล้ว 120,000 ล้านบาท แต่กลับไม่มีการชี้แจงในรายละเอียด ทั้งปริมาณข้าว ราคา และผลการขาดทุนแสดงให้เห็นถึงความไม่โปร่งใสในการดำเนินโครงการนี้ ซึ่งรัฐบาลขายข้าวในราคาต่ำกว่าราคาที่รับซื้อมาก
แหล่งข่าวจากวงการค้าข้าว ระบุว่า หากอ้างอิงจากข้อมูลของกระทรวงพาณิชย์เปรียบเทียบกับข้อมูลของคณะกรรมการปิดบัญชี ราคาที่รัฐบาลระบายข้าวเฉลี่ยจะอยู่ที่ประมาณกิโลกรัม 10-12 บาท เทียบกับราคาต้นทุน ที่รับจำนำที่ กิโลกรัมละ 26 บาท ทำให้รัฐบาลจะ ขาดทุนกิโลกรัมละประมาณ 14 บาทเป็นอย่างน้อย ในขณะที่ราคาตลาดปัจจุบันอยู่ที่กิโลกรัมละ 15-16 บาท